Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MIR6770-3-201ENST00000616362 60 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MIR6770-2-201ENST00000618304 60 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MIR6770-1-201ENST00000622248 60 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 HKR1-204ENST00000544914 2854 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A8-202ENST00000430155 2831 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GLDN-210ENST00000612989 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN21-205ENST00000543588 1870 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC01122-207ENST00000452840 4077 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D8-201ENST00000376840 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PARGP1-201ENST00000417555 2286 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CPT1B-203ENST00000395650 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SLC10A1-201ENST00000216540 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 HSPBAP1-201ENST00000306103 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DERL1-202ENST00000405944 1994 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB15-201ENST00000231173 4017 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 UBTFL5-201ENST00000443682 1191 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 VPS16-202ENST00000380445 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ABR-201ENST00000291107 2673 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SORBS2-203ENST00000319471 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD1B-203ENST00000456860 2805 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 IL21R-202ENST00000395754 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LDLR-205ENST00000557933 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3P5-203ENST00000586223 3083 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DDX3P1-201ENST00000418231 1950 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ZNF23-201ENST00000357254 3186 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms