Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 HEBP1-203ENST00000536942 2056 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PLP2-201ENST00000376322 620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 C19orf38-201ENST00000397820 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 EXOC7-206ENST00000406660 718 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AKIRIN1P2-201ENST00000440655 570 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 NDUFA13-204ENST00000507754 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 IGHVII-65-1-201ENST00000519992 302 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 IGLVI-63-201ENST00000524184 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC078925.1-201ENST00000535370 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 OPN1MW-201ENST00000595290 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 C10orf128-203ENST00000374153 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PABPC1L-207ENST00000372824 2223 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LEMD2-207ENST00000508327 1306 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 OR7E33P-201ENST00000437705 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 GPAT2P2-201ENST00000445404 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LINC00879-202ENST00000463200 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CLDND1-223ENST00000511081 642 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ALG1L14P-201ENST00000514230 434 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC090192.2-201ENST00000517482 553 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 TRIAP1-202ENST00000546954 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC074052.1-201ENST00000567734 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC022146.2-201ENST00000605980 348 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 IFI27-212ENST00000618863 505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL590556.2-201ENST00000637118 1162 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL669970.2-201ENST00000446184 280 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL354733.3-201ENST00000448389 390 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL357060.2-204ENST00000448942 963 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 HOPX-209ENST00000508121 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CNDP2-228ENST00000584768 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC138907.9-201ENST00000623747 986 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL590552.1-201ENST00000623164 1770 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms