Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 PRDM11-204ENST00000530656 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRAF6Q9Y4K3 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRAF6Q9Y4K3 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRAF6Q9Y4K3 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRAF6Q9Y4K3 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TRAF6Q9Y4K3 TMEM185A-210ENST00000613273 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TRAF6Q9Y4K3 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TRAF6Q9Y4K3 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TRAF6Q9Y4K3 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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