Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AL606760.3-201ENST00000569869 3591 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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