Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN2P17655 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms