Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK8P49336 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms