Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PCDHB11-201ENST00000354757 4198 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 KCNAB1-201ENST00000302490 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC097652.1-201ENST00000511385 2114 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PCDHGA2-202ENST00000528330 4543 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP27-202ENST00000376922 3628 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 BCL2L13-207ENST00000418951 5062 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 WDR47-203ENST00000369962 4199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LRRC8A-202ENST00000372599 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ETFBKMT-205ENST00000538463 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 TIFAB-201ENST00000537858 5923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 NEK1-201ENST00000439128 5653 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ANO1-207ENST00000530676 3289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 DCK-204ENST00000504952 2614 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 IFT80-201ENST00000326448 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG6-204ENST00000449001 3111 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 XRRA1-201ENST00000321448 4695 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AL445647.1-201ENST00000606221 3599 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LINC00452-202ENST00000609661 2896 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 Z97192.1-201ENST00000391625 3894 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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