Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CDK8P49336 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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