Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EPCAMP16422 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms