Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK8P49336 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK8P49336 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms