Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 IGSF3-202ENST00000369483 7326 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MPP4-204ENST00000409143 2082 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC005041.1-201ENST00000517883 7033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LIF-201ENST00000249075 3969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ENPP4-201ENST00000321037 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RNF13-203ENST00000392894 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 DPY19L2P2-204ENST00000438364 3947 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CDKL2-201ENST00000307465 2565 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MTMR2-202ENST00000352297 3350 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RDH16-202ENST00000398138 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TAF1C-201ENST00000341690 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TGOLN2-206ENST00000444342 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 DENND2A-210ENST00000537639 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC122688.3-201ENST00000623804 3467 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ELP4-212ENST00000638764 2456 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 PRKACB-206ENST00000370689 4513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC9-201ENST00000357166 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SLC12A8-202ENST00000430155 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 NUAK2-201ENST00000367157 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 E2F8-205ENST00000620009 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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