Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGNL1Q0VF96 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms