Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL4A3BPQ9Y5P4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A3BPQ9Y5P4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms