Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAI2Q9Y5P3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAI2Q9Y5P3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms