Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms