Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITM2BQ9Y287 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITM2BQ9Y287 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms