Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC13A4Q9UKG4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC13A4Q9UKG4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms