Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3LQ9UJW3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3LQ9UJW3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3LQ9UJW3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms