Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCP2D1Q9UJQ7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCP2D1Q9UJQ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms