Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms