Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH4Q9P2E8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH4Q9P2E8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms