Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTTNBP2NLQ9P2B4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms