Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMG20BQ9P0W2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms