Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALKBH4Q9NXW9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms