Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPRMQ9NS64 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPRMQ9NS64 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms