Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms