Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN4Q9NQP4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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