Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms