Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C6orf50Q9HD87 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C6orf50Q9HD87 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C6orf50Q9HD87 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms