Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABEP2Q9H5N1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms