Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRN3Q9H3W5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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