Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GANQ9H2C0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GANQ9H2C0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GANQ9H2C0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GANQ9H2C0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GANQ9H2C0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GANQ9H2C0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GANQ9H2C0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GANQ9H2C0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GANQ9H2C0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GANQ9H2C0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms