Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC113Q9H0I3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC113Q9H0I3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC113Q9H0I3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC113Q9H0I3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC113Q9H0I3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC113Q9H0I3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC113Q9H0I3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC113Q9H0I3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms