Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMYND12Q9H0C1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMYND12Q9H0C1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms