Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1EQ9GZS1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR1EQ9GZS1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms