Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
YIPF3Q9GZM5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
YIPF3Q9GZM5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms