Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
YTHDF1Q9BYJ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF1Q9BYJ9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms