Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPL4Q9BYD3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPL4Q9BYD3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms