Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD1Q9BXT4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD1Q9BXT4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms