Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRTQ9BXP5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms