Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGR4Q9BXB1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms