Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM14BQ9BX40 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms