Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG101Q9BSB4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG101Q9BSB4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms