Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2D3AQ9BRG2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms