Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRBNQ96SW2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CRBNQ96SW2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms