Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCCC1Q96RQ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms