Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms