Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF560Q96MR9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF560Q96MR9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms