Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP57Q96MR6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP57Q96MR6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms