Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX27Q96L92 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX27Q96L92 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms